Основан в январе 2005 года. В 2005 году клуб выступал в Любительской футбольной лиге (МФС Приволжье), где занял 1-е место, получив право играть во втором дивизионе. В 2008 году клуб оказался в тяжёлой финансовой ситуации и занял предпоследнее место в зоне «Урал-Поволжье», проиграв 30 матчей из 34-х. В 2009 году профессиональный футбольный клуб «Юнит» прекратил своё существование и на его базе были созданы любительские команды «Юнит» (г. Самара) выступающие в Чемпионате города и области, а также детская футбольная школа «Юнит».
